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PGPR(植物根际促生菌)的促生作用如下：一是提供养分：固氮、溶磷、铁载体等；二是促生长：植物***、次级代谢产物、诱导植物基因表达改善生理机能；三是抗病作用：拮抗作用、产生***、诱导植物系统抗性；四是抗虫作用、抗逆作用和土壤修复作用。***微生物菌剂的以下3种主要功能：一是植物营养促生作。二是抑菌抗病诱导抗性；三是寄生害虫侵染致病。市面上常见的微生物肥料有三种：复合微生物肥料：执行标准NY/T798-2015，有效活菌数大于等于0.2亿/克。农用微生物菌剂：国家标准（GB 20287-2006）中规定其3中剂型的有效活菌数，液体大于等于2亿/ml，粉剂大于等于2亿/g，颗粒大于等于1亿/g。生物有机肥：执行标准（NY 884-2012）规定：有效活菌数大于等于0.2亿/g。
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生物肥就是用化学合成的方法生产的肥料，包括氮、磷、钾肥和复合肥。化肥的出现解决了粪肥的运输不便的问题，而且养分含量高，容易被吸收，肥效快，被称之为速溶性肥料。人们温饱问题的解决，化肥功不可没。化肥的缺点也是显而易见的，首先是养分单一，**是氮磷钾，如果长期单一使用化肥的话，很容易形成土壤固化，造成土壤有机质缺乏，土壤板结酸化，土传病害滋生，**终会导致农产品品质、产量的下降。土壤有机质缺乏，土壤板结酸化，土传病害滋生，**终会导致农产品品质、产量的下降。
生物有机肥在施用技术上的注意事项：一要足墒施用。无论采用哪种施肥方法，都要在墒情适宜的情况下施用，这样肥料才能迅速分解、扩散、渗透，被作物尽快吸收转化。二要适时适温施用。应根据不同作物的特性、生育期长短确定施肥时间，比如绿叶类的蔬菜生育期短，一般宜作基肥施用；棉花生育期长，既可作基肥施用，又可在蕾期作当家肥施用；果树一般提倡在12月至翌年1月施用。气温低于5℃或高于35℃时一般不宜施用，以10℃-25℃时施用效果比较好。三要优化施用方法。生物有机肥要尽量提早施用，每亩的施用量不少于40公斤，与***化肥配合施用效果更好。
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生物肥对于果树主要有5大作用：一、改变根量，由细菌产生的IAA、GA、CTK使植物次生根增殖，增加有效根量。二、软化细胞壁，细菌产生的半聚糖醛酸转化酶（PATA）可软化根系细胞壁，从而促进营养吸收。三、产生转铁产物，细菌产生的转铁产物可聚合或螯合土壤铁，使之成为对果树更有效的物质。四、增加磷的有效性，细菌分泌出增加石灰性土壤中磷有效性的酸性物和螯合物。五、阻止病害，细菌改变根际环境，从而***根系病原体的竞争力。
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生物肥改良土壤作用。微生物肥料中有益微生物能产生糖类物质，与植物粘液，矿物胶体和有机胶体结合在一起，可以改善土壤团粒结构，增强土壤的物理性能和减少土壤颗粒的损失，在一定的条件下，还能参与腐殖质形成。所以施用微生物肥料能改善土壤物理性状，有利于提高土壤肥力。 微生物肥料提供对作物生长有益的微生物，通过其分解、转化等作用，土壤中有很多种养分才能被作物吸收利用。有益微生物含量少的土地，农作物必需的营养元素就不能被很好吸收和利用。有针对性地使用微生物菌肥料，可以***地提高土壤肥力，增加植物养分的供应量，促进植物生长，还能长效地修复和保护地力。
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